ChromosOmics - Database



                                                     - CHROMOSOME  5q1 -                                                   



p1 q1 q2 q3
References
5q11 5q12 5q13 5q14 5q15


5q11
48,400,001-58,900,000

case no.
alternative case number
rearrangement mol. breakpoint (hg19)
test methods Reference
5q11/1-1




{0}

5q11.1
48,400,001-50,700,000

case no.
alternative case number
rearrangement mol. breakpoint (hg19)
test methods Reference
5q11.1/1-1
5p12/5-1 der(5)(pter->q11.1::p12->qter) ~48.9-50.2 Mb
MCB {0}

5q11.2
50,700,001-58,900,000

case no.
alternative case number
rearrangement mol. breakpoint (hg19)
test methods Reference
5q11.2/1-1
12q12/3-1 t(5;12)(q11.2;q12)
~51-55 Mb
wcp, LSP
{0}
5q11.2/2-1
21p13/2-1 t(5;21)(q11.2;p13)
~51.2-58.4 Mb
wcp, LSP
{0}
5q11.2/3-1
5q21.3/2-1 inv(5)(q11.2q21.3~22)
~51.2-58.4 Mb
MCB
{0}
5q11.2/4-1
5q33.2/1-1 inv(5)(q11.2q33.2)
~51.2-58.4 Mb
MCB
{0}
5q11.2/5-1
5q13/8-1
15p11.2/4-1
del(5)(q11.2),
der(15)t(5;15)(5qter->5q13:
:5q11.2->5q13::15p11.2->15qter)
~51.2-58.4 Mb
MCB, LSP
{0}
5q11.2/6-1
5q13.3/3-1 inv(5)(q11.2q13.3)
~51-52 Mb
MCB
{0}
5q11.2/7-1
5q15/7-1
15p12/4-1
der(5)t(5;15)
(q11.2;p12),
der(15)t(5;15)(q11.2;p12)
inv(5)(q11.2q15)
~51.2-58.4 Mb MCB
{0, 22}

5q12
58,900,001-66,700,000

case no.
alternative case number
rearrangement mol. breakpoint (hg19)
test methods Reference
5q12/1-1
17q12/1-1 t(5;17)(q12;q12)
~59.4-66.2 Mb
MCB, LSP
{0}
5q12/2-1
13q22/9-1
14q13/2-1
der(5)t(5;14)
(q12;q13),der(13)
t(5;13)(q12;q22), 
 der(14)t(13;14)(q22;q13)
~59.4-66.2 Mb
MCB
{0}
5q12/3-1
5q34/7-1 inv(5)(q12q34)
~59.4-66.2 Mb
MCB
{0,  6}

5q12.1
58,900,001-62,900,000

case no.
alternative case number
rearrangement mol. breakpoint (hg19)
test methods Reference
5q12.1/1-1




{0}

5q12.2
62,900,001-63,200,000

case no.
alternative case number
rearrangement mol. breakpoint (hg19)
test methods Reference
5q12.2/1-1
3q26.2/2-1
5p15.1/2-1
der(3)t(3;5)(q26.2;p15.1),
inv(5)(p15.1q12.2),
t(3;5)(q26.2;p15.1)
~63 Mb
MCB, LSP
{0}

5q12.3
63,200,001-66,700,000

case no.
alternative case number
rearrangement mol. breakpoint (hg19)
test methods Reference
5q12.3/1-1




{0}

5q13
66,700,001-76,900,000

case no.
alternative case number
rearrangement mol. breakpoint (hg19)
test methods Reference
5q13/1-1
2p11.2/1-1
3p25/2-1
3p14/1-1 
t(2;5)(p11.2;q13)[3/30],
inv(3)(p14p25)
~67.2-76.4 Mb
MCB
{0}
5q13/2-1
13q14.1/1-1 t(5;13)(q13;q14) ~67.2-76.4 Mb LSP
{0, 5}
5q13/3-1
18q11.2/3-1
18q22.2/1-1
ins(5;18)(q13;q22.2q11.2) ~67.2-76.4 Mb MCB
{0}
5q13/4-1
20q11.2/1-1 t(5;20)(q13;q11.2)  ~67.2-76.4 Mb wcp, LSP
{0}
5q13/5-1
21q11.2/2-1 t(5;21)(q13;q11.2) ~67.2-76.4 Mb MCB
{0}
5q13/6-1
5p14/3-1 inv(5)(p14q13) ~67.2-76.4 Mb wcp, LSP {0}
5q13/7-1
5q35.2/6-1
10q26.1/3-1
13q31/1-1
inv(5)(q13q35.2),
t(10;13)(q26.1;q31)
~67.2-76.4 Mb MCB
{0, 11 case I-40}
5q13/7-2
5q35.2/6-2
inv(5)(q13q35.2)
~67.2-76.4 Mb MCB
{0, 11 case I-43}
5q13/8-1
5q11.2/5-1
15p11.2/4-1
del(5)(q11.2),
der(15)t(5;15)(5qter->5q13:
:5q11.2->5q13::15p11.2->15qter)
~67.2-76.4 Mb MCB, LSP {0}

5q13.1
66,700,001-68,400,000

case no.
alternative case number
rearrangement mol. breakpoint (hg19)
test methods Reference
5q13.1/1-1
6q22.1/1-1
6q23.3/1-1
8p11.2/2-1
der(5)t(5;6;8)
(5pter->5q13.1~13.2:
:6q22.1->6q23.3:
:8p11.2->8pter),
der(8)t(5;8)(q13.1~13.2;p11.2),
del(6)(q22.21q23.3)
~68-71 Mb
MCB
{0}
5q13.1/2-1
5p14/2-1
inv(5)(p14q13.1) ~67.2-67.9 Mb
MCB, LSP
{0}
5q13.1/3-1
5p15.3/6-1 inv(5)(p15.3q13.1) ~67.2-67.9 Mb MCB
{0}

5q13.2
68,400,001-73,300,000

case no.
alternative case number
rearrangement mol. breakpoint (hg19)
test methods Reference
5q13.2/1-1
3p21.3/2-1 t(3;5)(p21.3;q13.2) ~70-73 Mb
MCB, LSP
{0, 11 case T-33}
5q13.2/2-1
11q13.5/1-1 t(5;11)(q13.2;q13.5) ~69.1-72.7 Mb
MCB
{0}
5q13.2/3-1
12q12/4-1 t(5;12)(q13.2;q12~13.1) ~69.1-72.7 Mb
MCB
{0}

5q13.21
not included in UCSC!

case no.
alternative case number
rearrangement mol. breakpoint (hg19)
test methods Reference
5q13.21/1-1




{0}

5q13.22
not included in UCSC!

case no.
alternative case number
rearrangement mol. breakpoint (hg19)
test methods Reference
5q13.22/1-1




{0}

5q13.23
not included in UCSC!

case no.
alternative case number
rearrangement mol. breakpoint (hg19)
test methods Reference
5q13.23/1-1




{0}

5q13.3
73,300,001-76,900,000

case no.
alternative case number
rearrangement mol. breakpoint (hg19)
test methods Reference
5q13.3/1-1
4q13.3/2-1 t(4;5)(q13.3~21.1;q13.3)  ~73.9-76.4 Mb
MCB
{0}
5q13.3/2-1
16p13.3/2-1 t(5;16)(q13.3;p13.3) ~73.9-76.4 Mb MCB, LSP
{0, 10 case 12,
11 case T62}

5q13.3/2-2
16p13.3/2-2 t(5;16)(q13.3;p13.3) ~73.9-76.4 Mb MCB, LSP
{0, 11 case T-63}
5q13.3/3-1
5q11.2/6-1
inv(5)(q11.2q13.3) ~74 Mb
MCB
{0}
5q13.3/4-1
21q21/1-1
t(5;21)(q13.3;q21) ~73.9-76.4 Mb MCB
{0}
5q13.3/5-1
5q31.1/9-1 inv(5)(q13.3q31.1) ~73.9-76.4 Mb MCB
{0}
5q13.3/6-1
5q33/2-1
9q21.1/1-1
9q22.3
/2-1

der(5)(5pter->5q13.3:
:5q33->5q13.3::9q22.3->
9q21.1::5q33->5qter),der(9)(pter->q21.1::q22.3->qter)
~73.9-76.4 Mb MCB
{0}
5q13.3/7-1
5q33.1/5-1 inv(5)(q13.3q33.1) 74.962850-75.135120 Mb MCB, LSP
{0, 33 case 1,
39 case 1}


5q14
76,900,001-92,300,000

case no.
alternative case number
rearrangement mol. breakpoint (hg19)
test methods Reference
5q14/1-1
 
 
 
{0}

5q14.1
76,900,001-81,400,000

case no.
alternative case number
rearrangement mol. breakpoint (hg19)
test methods Reference
5q14.1/1-1
1p31.3/2-1 t(1;5)(p31.3;q14.1) ~77.4-80.9 Mb
MCB; LSP {0}
5q14.1/2-1
2q22.1/1-1 t(2;5)(q22.1;q14.1) ~77.4-80.9 Mb MCB {0}
5q14.1/3-1
4q24/1-1
5q23.2/1-1
5q32/1-1
6q12/2-1
der(4)t(4;5;6)(4pter->4q24:
:5q14.1->5q23.2::5q32~33.1
->5q23.2::6q12->6qter),
der(5)t(4;5)(q24;q14),
der(6)t(5;6)(q32~33.1;q12
)
~77.4-80.9 Mb MCB {0, 55}
5q14.1/4-1
13q21.2/1-1 t(5;13)(q14.1;q21.2) ~77.4-80.9 Mb MCB, LSP
{0}

5q14.2
81,400,001-82,800,000

case no.
alternative case number
rearrangement mol. breakpoint (hg19)
test methods Reference
5q14.2/1-1




{0}

5q14.3
82,800,001-92,300,000

case no.
alternative case number
rearrangement mol. breakpoint (hg19)
test methods Reference
5q14.3/1-1
5q22.1/2-1 del(5)(q14.3q22.1)
~83.3-91.8 Mb
MCB
{0}
5q14.3/2-1
5q15/6-1 del(5q14.3~15q15)
~85-95 Mb
MCB, LSP
{0}

5q15
92,300,001-98,200,000

case no.
alternative case number
rearrangement mol. breakpoint (hg19)
test methods Reference
5q15/1-1
8q23/2-1 t(5;8)(q15;q23~24.1)
~92.8-97.7 Mb
MCB
{0, 10, case 11,
11 case T-58}

5q15/2-1
5q31.1/5-1 inv(5)(q15q31.1)
~92.8-97.7 Mb
MCB
{0}
5q15/2-2
5q31.1/5-2 inv(5)(q15q31.1)
~93-95 Mb
MCB
{0}
5q15/3-1
5q23.2/4-1 inv(5)(q15q23.3)
~92.8-97.7 Mb
MCB
{0}
5q15/3-2
5q23.2/4-2 inv(5)(q15q23.3)
~96.0-98.0 Mb
wcp, LSP
{0}
5q15/4-1
5q23.3/4-1 inv(5)(q15q23.3~q31)
~92.8-97.7 Mb
MCB
{0}
5q15/5-1
5p15.2/4-1 inv(5)(p15.2~15.1q15) ~92.8-97.7 Mb
MCB
{0}
5q15/6-1
5q14.3/2-1 del(5q14.3~15q15) ~95-97.7 Mb
MCB, LSP
{0}
5q15/7-1
5q11.2/7-1
15p12/4-1
der(5)t(5;15)
(q11.2;p12),
der(15)t(5;15)(q11.2;p12)
inv(5)(q11.2q15)
~95-97.7 Mb
MCB
{0, 22}
5q15/8-1
12q21.33/1-1 t(5;12)(q15;q21.33)
~92.8-97.7 Mb
MCB
{0}
5q15/9-1
9q31/2-1 t(5;9)(q15~21.1;q31)
~ 95.882222-101.398262 Mb
wcp, LSP
{0}